1929 wurde er zum aargauischen Staatsarchivar und Kantonsbibliothekar gewählt. Seit 1930 Vorsitzender der «Aargauischen Historischen Gesellschaft», wurde er 1932 Redakteur der Zeitschrift für schweizerische Geschichte. Ab 1955 lehrte Ammann als Honorarprofessor für Wirtschaftsgeschichte an der Universität Mannheim, von 1958 bis 1963 hatte er eine ausserordentliche Professur an der Universität Saarbrücken inne. Von 1960 bis zu seinem Tod war er Direktor des Instituts für Landeskunde der Saarlande.